Таксономия Rickettsials

Риккетсии
Семейство Rickettsiaceae
Таксономия Rickettsials
Краткая характеристика рода Rickettsia
Антигенное строение риккетсий
Культуральные и физиологические особенности
Микроэкология возбудителей, круг хозяев и среда естественного обитания
Генетическая характеристика
Факторы патогенности
Клинические проявления в связи с особенностями инфекционного процесса
Основные нозологические формы и особенности клинического и эпидемиологического проявления риккетсиозов
Иммунитет при риккетсиозах
Эколого-эпидемиологическая характеристика
Микробиологическая диагностика риккетсиозов
Определение чувствительности к антибактериальным препаратам
Лечение и профилактика
Апатогенные риккетсии и концепция эндоцитобиоза прокариотов
Географическое распространение риккетсий группы КПЛ
Экспериментальные методы изучения риккетсии в переносчиках

При изучении риккетсий наиболее применяемыми генами являются: ген, кодирующий 16S рРНК, ген gltA, гены отрА и отрВ, а также применяемый с недавних пор «gene D» (Roux, Raoult, 1997; Roux et al, 1997; Fournier et al., 1998; Roux and Raoult, 2000; Sekeyova et al., 2001). Ген, кодирующий 16S рРНК, является первым геном, секвенированным в риккетсиальном геноме. Поскольку этот панбактериальный ген присутствует у всех прокариотов, определение его первичной структуры позволяет изучать степень гомологии микроорганизмов, строить филогенетические древа и изучать их эволюционные связи. Сравнение этого гена у изучаемых риккетсий позволило провести их филогенетический анализ. Нуклеотидные последовательности всех изученных риккетсий имели высокую степень гомологии по этому гену - от 99,9 до 97,2 % (Roux, Raoult, 1997, Roux et al., 1997). Именно по этой причине применение данных секвенсов 16S рРНК наиболее целесообразно при осуществлении филогенетического анализа внутри таксономических категорий от рода и выше (рис. 2).

Для осуществления подобной задачи внутри рода Rickettsia более информативным является применение данных, полученных при секвенировании гена gltA, где степень гомологии между видами риккетсий составила от 99,9 до 86,2 %. Как известно, цитратсинтаза является компонентом почти всех живых клеток и ферментом главного цикла метаболизма — цикла лимонной кислоты, играющей ключевую роль в выработке энергии и в обеспечении важнейших биосинтетических метаболитов.

Изучение нуклеотидных последовательностей гена gltA и дальнейший филогенетический анализ среди представителей родов Rickettsia (Roux et al., 1997), Ehrlichia (Inokuma et al., 2001) и Bartonella (Birtles et al., 1995; Joblet et al., 1995) показал более высокую вариабельность этого гена, чем гена 16S рРНК. Следовательно, этот инструмент позволяет находить большие различия среди близкородственных видов. В настоящее время этот инструмент применяется для изучения практически всех риккетсий и в некоторых случаях является наиболее адекватным, когда применение других генов при выявлении и изучении риккетсий не дает удовлетворительных результатов (отрА, отрВ и «gene D»), а применение гена, кодирующего 16S рРНК, при первичной идентификации риккетсий в членистоногих сопряжено с высокой вероятностью контаминации.

В связи с невозможностью амплифицировать ген отрА у представителей группы СТ его применение ограничивается пределами группы КПЛ, где степень гомологии между видами риккетсий оценивается от 99,9 до 94,9 %. Сопоставление секвенсов gltA и отрА генов позволило установить области их оптимального применения среди представителей рода Rickettsia (рис. 3) (Raoult, Roux, 1997). Применение гена отрА наиболее оправдано при изучении риккетсий группы КПЛ.

Страница 1 | Страница 2 | Страница 3 | Страница 4 | Страница 5

Читайте также:
»Иксодовые клещи и клещевые инфекции
»Клещевой риккетсиоз
»История изучения риккетсиоза
»Микробиологическая и эпидемиологическая характеристика очагов клещевого риккетсиоза в Сибири и на Дальнем востоке России
»Клиника, диагностика и лечение клещевого риккетсиоза
»Основные направления эпидемиологического надзора за риккетсиозами
»Фото переносчиков клещевого риккетсиоза

»Список сокращений