Генетическая характеристика

Риккетсии
Семейство Rickettsiaceae
Таксономия Rickettsials
Краткая характеристика рода Rickettsia
Антигенное строение риккетсий
Культуральные и физиологические особенности
Микроэкология возбудителей, круг хозяев и среда естественного обитания
Генетическая характеристика
Факторы патогенности
Клинические проявления в связи с особенностями инфекционного процесса
Основные нозологические формы и особенности клинического и эпидемиологического проявления риккетсиозов
Иммунитет при риккетсиозах
Эколого-эпидемиологическая характеристика
Микробиологическая диагностика риккетсиозов
Определение чувствительности к антибактериальным препаратам
Лечение и профилактика
Апатогенные риккетсии и концепция эндоцитобиоза прокариотов
Географическое распространение риккетсий группы КПЛ
Экспериментальные методы изучения риккетсии в переносчиках

Применение прогрессивных молекулярно-биологических технологий, в первую очередь секвенирования, позволило определить нуклеотидные последовательности полноразмерного генома ряда представителей семейства Rickettsiaceae.

По данным на октябрь 2010 года, в GenBank было размещено для открытого доступа 15 полноразмерных геномов представителей этого семейства (Orientia tsutsugamushi str. Ikeda Rickettsia africae ESF-5, R. akari str. Hartford, R. bellii OSU 85-389, R. bellii RML369-C, R. canadensis str. McKiel, R. conorii str. Malish 7, R. felis URRWXCal2, R. massiliae MTU5, R. peacockii str. Rustic, R. prowazekii str. Madrid E, R. rickettsii str. Iowa, R. rickettsii str. 'Sheila Smith', R. sibirica 246, R. typhi str. Wilmington).

При изучении геномов этой группы микроорганизмов были получены данные о длине генома, соотношения гуанин/цитозин (Г/Ц), проценте кодирующей ДНК, количестве генов, в том числе кодирующих белки, структурной РНК, наличии псевдогенов и определен вид хромосомы (циркулярная, линейная).

Сопоставление полученных данных показало разнообразие генетических характеристик риккетсий.

Наименьший размер генома у изученных микроорганизмов был определен у представителей группы сыпного тифа: R. typhi str. Wilmington - 1,111,496 пар оснований (п.о.) и R. prowazekii str. Madrid Е- 1,111,523 п.о.

У представителей группы КПЛ размер генома составил от 1,231,060 у R. akari str. Hartford до 1,485,148 п.о. у R. felis URRWXCal2, оба вида в настоящее время отнесены к подгруппе R. akari.

Наибольший размер генома из всех изученных на данный момент риккетсии у представителя группы «предшественников» R. bellii, 1,528,980 п.о. - у штамма OSU 85-389 и 1,522,076 - у RML369-C. При этом различие размеров геномов между двумя штаммами одного вида составило 0,45 %.

Таким образом, наличие наибольшего размера генома у R. bellii из группы «предшественников», а наименьшего - у риккетсий группы сыпного тифа косвенно подтверждает гипотезу о редукции генома у адаптированных к теплокровным видам риккетсий (вызываемый R. prowazekii сыпной тиф - антропоноз).

Из всех представителей рода Rickettsiaceae самый большой размер генома представлен у О. tsutsugamushi str. Ikeda - 2,008,987 п.о.

Показатель процентного соотношения Г/Ц внутри подгрупп риккетсии достаточно хорошо коррелирует с классификацией этой группы микроорганизмов. Он наиболее высок и стабилен у риккетсий группы КПЛ - 32, у представителей группы «предшест венников» (R. bellii, R. Canadensis) - 31, у О. tsutsugamushi - 30. Наименьшая величина этого показателя выявлена у R. prowazekii - 29 и R. typhi - 28.

У различных штаммов одного вида риккетсий хромосомы могут иметь разный вид. У штамма OSU 85-389 R. bellii хромосома имеет линейную конфигурацию, а у штамма RML369-CR - циркулярную. У штамма «Sheila Smith» R. rickettsii хромосома также имеет линейную конфигурацию, а у штамма Iowa - циркулярную.

Наибольшее количество генов - 2005 - установлено у О. tsutsugamushi str. Ikeda, наименьшее - у R. prowazekii str. Madrid Е.

Количество генов в геноме также варьирует у различных штаммов одного вида риккетсий. У R. rickettsii геном штамма str. Iowa содержит 1494 гена, а штамма «Sheila Smith» - 1379.

Процент кодирующей ДНК варьирует от 67 у R. peacockii str. Rustic до 84 % у R. bellii RML369-C. Причем если у двух изученных штаммов R. rickettsii он стабилен и составляет 76 %, то у R. bellii - от 80 до 84%.

Геномы некоторых видов риккетсий имеют псевдогены.

К настоящему времени имеются данные о наличии плазмид у некоторых видов риккетсий, и их нуклеотидные последовательности депонированы в GenBank (R. massiliae MTU5, R. felis URRWXCatt R. felis URRWXCatt, R. africae ESF, R. monacensis plasmid Prm, R. peacockii str. Rustic и др.).

Таким образом, риккетсии имеют различные генетические характеристики, и можно предположить, что дальнейшее их изучение может вызвать реклассификацию данной группы микроорганизмов.

Читайте также:
»Иксодовые клещи и клещевые инфекции
»Клещевой риккетсиоз
»История изучения риккетсиоза
»Микробиологическая и эпидемиологическая характеристика очагов клещевого риккетсиоза в Сибири и на Дальнем востоке России
»Клиника, диагностика и лечение клещевого риккетсиоза
»Основные направления эпидемиологического надзора за риккетсиозами
»Фото переносчиков клещевого риккетсиоза

»Список сокращений