Таксономия Rickettsials |
Риккетсии
Изучение структуры генов рРНК позволило провести разделение клеточных форм жизни на три домена (царства) - Archaea, Eukaria и Bacteria (Woese et al., 1990). Только среди представителей царства Archaea к настоящему времени не выявлено представителей, вызывающих заболевания человека (рис. 1) (Расе, 1997; Eckburg, 2003). По установленной Карлом Линнеем (Von LINNE) бинарной номенклатуре, каждый вид прокариотического организма должен быть включен в род. Род является категорией последовательно более высоких разрядов: подтриба, триба, подсемья, семья, подпорядок, порядок, подкласс, класс, тип (или филюм) и царство (или империя) (табл. 2). Разряды подтриба и триба выведены из употребления. Категории тип (или филюм) и царство (или империя) не поддерживаются «Rules Bacteriologocal Code» (1990 Revision) (Lapage et al., 1992). В настоящее время два домена (domain) прокариот подразделены на 26 типов (филий), 2 из которых находятся в пределах Archaea и 24 типа образуют домен Bacteria. Тип Proteobacteria (Phylum BXII) состоит из пяти классов: Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Deltaproteobacteria и Epsilonproteobacteria. Класс Alphaproteobacteria (Class I.) включает семь порядков (Order):
Порядок Rickettsiales включает три семейства: Rickettsiaceae (рода Rickettsia и Orientia), Anaplasmataceae (рода Anaplasma, Aegyptianella, Ehrlichia, NeoRickettsia, Wolbachia и Xenohaliotis, род Cowdria утратил свое значение, так как единственный представитель Cowdria ruminantium переведен в род Ehrlichia) и Holosporaceae (род Holospora), также в него включено 6 родов с неопределенным местоположением (Caedibacter, Lyticum, «Odyssella», Pseudocaedibacter, Symbiotes и Tectibacter) (табл. 3). Сейчас идентификация филогенетического положения прокариот, в том числе некультивируемых, развивается на основе изучения нуклеотидных последовательностей 16S рибосомальной РНК. Секвенирование, ставшее рутинной процедурой, и возможность мгновенной идентификации нуклеотидной последовательности в GenBank через Интернет сделали этот подход фактически безальтернативным при определении родовой принадлежности микроорганизмов. Установление видовой принадлежности оценивают по степени гомологии ДНК-ДНК с депонированными нуклеотидными последовательностями. К достоинствам созданной филогенетической системы относится почти полная согласованность результатов, получаемых в разных лабораториях. Страница 1 | Страница 2 | Страница 3 | Страница 4 | Страница 5 Читайте также: »Иксодовые клещи и клещевые инфекции »Клещевой риккетсиоз »История изучения риккетсиоза »Микробиологическая и эпидемиологическая характеристика очагов клещевого риккетсиоза в Сибири и на Дальнем востоке России »Клиника, диагностика и лечение клещевого риккетсиоза »Основные направления эпидемиологического надзора за риккетсиозами »Фото переносчиков клещевого риккетсиоза »Список сокращений |