Таксономия Rickettsials |
Риккетсии
Наиболее эффективно применение гена gltA в качестве гена-мишени для изучения филогенетической позиции риккетсий группы СТ, R. helvetica, кластера R. australis – R. akari, а также кластера R. canadensis. Филогенетический анализ риккетсий, выполненный на основании сравнения нуклеотидных последовательностей 16S рРНК гена, позволил подтвердить эволюционное единство риккетсий (Stochard and Fuerst, 1995). В то же время результаты сравнения этих нуклеотидных последовательностей подтвердили, что R. canadensis, R. bellii и АВ bacterium располагаются в эволюционном отношении за пределами обеих - СТ и КПЛ - групп и появились до разделения риккетсий на эти две группы, что согласуется с гипотезой Stochard D.R. и Fuerst Р.А (1995); группа СТ содержит ; только R. prowazekii и R. typhi; экологически связанные с иксодовыми клещами R. helvetica и R. australis и гамазовыми клещами R. akari филогенетически связаны с кластером риккетсий группы КПЛ. В пределах группы КПЛ риккетсий могут быть подразделены на четыре подгруппы: R. rickettsii, R. massiliae, R. akari и R. helvetica. В настоящее время для классификации риккетсий наибольшее значение имеют методы геносистематики. Ad Hoc Committee for Re-Evalution of the Species Definition in Bacteriology (Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, № 52, - P. 1043-1047) для этих целей считает необходимым определение нуклеотидных последовательностей не менее пяти генов, включая кодирующие основные белки. Применительно к риккетсиям для этих целей предлагается изучать панбактериальные гены, кодирующие 16S rRNA и цитратсинтазу (gltA), Rickettsia - специфические ОтрА и ОтрВ гены и ген D, кодирующие поверхностные высокомолекулярные белки rОтрА (190КД) и rОтрВ (120 КД), PS120 (термостабильный цитоплазменный белок) соответственно. Конкретные критерии для дифференциации риккетсий на уровне рода, вида и группы приведены в работе Fournier et al. (2003) (рис. 4). Эти критерии могут быть использованы для официального описания риккетсий как нового вида только при наличии изученных изолятов (Raoult et al., 2005). В соответствии с этими критериями R.sp.BJ-90 и R. mongolotimonae относятся к виду R. sibirica, в котором выделяют подвиды R. sibirica subsp. sibirica, R. sibirica subsp.BJ-90, R. sibirica subsp.mongolotimonae. С появлением молекулярной классификации многие недавно описанные виды риккетсий были первоначально идентифицированы генетически до их культивирования в лаборатории. Как и в случаях с другими бактериями, риккетсиям присваивается статус «Candidatus», если были изучены свойства их генома, но не были изучены их фенотипические характеристики. Страница 1 | Страница 2 | Страница 3 | Страница 4 | Страница 5 Читайте также: »Иксодовые клещи и клещевые инфекции »Клещевой риккетсиоз »История изучения риккетсиоза »Микробиологическая и эпидемиологическая характеристика очагов клещевого риккетсиоза в Сибири и на Дальнем востоке России »Клиника, диагностика и лечение клещевого риккетсиоза »Основные направления эпидемиологического надзора за риккетсиозами »Фото переносчиков клещевого риккетсиоза »Список сокращений |