Таксономия Rickettsials

Риккетсии
Семейство Rickettsiaceae
Таксономия Rickettsials
Краткая характеристика рода Rickettsia
Антигенное строение риккетсий
Культуральные и физиологические особенности
Микроэкология возбудителей, круг хозяев и среда естественного обитания
Генетическая характеристика
Факторы патогенности
Клинические проявления в связи с особенностями инфекционного процесса
Основные нозологические формы и особенности клинического и эпидемиологического проявления риккетсиозов
Иммунитет при риккетсиозах
Эколого-эпидемиологическая характеристика
Микробиологическая диагностика риккетсиозов
Определение чувствительности к антибактериальным препаратам
Лечение и профилактика
Апатогенные риккетсии и концепция эндоцитобиоза прокариотов
Географическое распространение риккетсий группы КПЛ
Экспериментальные методы изучения риккетсии в переносчиках

Применение подходов молекулярной классификации, таких как соотношение G/C в ДНК (32-33 % для риккетсий группы КПЛ и 29 % для группы СТ) и ДНК/ДНК реассоциация (Weyne et al., 1987), является возможным применительно к риккетсиям, однако имеет определенные сложности. Секвенирование генов или их фрагментов нашло более широкое применение среди методов идентификации риккетсиальных изолятов (Roux, Raoult, 1995; Roux et al., 1997; Fournier et al., 1998, Roux, Raoult, 2000; Sekeyova et al., 2001). Однако неофициальные правила, применяемые в классификации этих бактерий, в части определения статуса родов и видов часто приводили к путанице. Считалось, что различные штаммы принадлежат к одному виду, если они имеют 70 и более процентов гомологии ДНК (Wayne et al., 1987). Но уровень гомологии 70 % является относительным. Например, R. rickettsii, R. conorii, R. sibirica и R. montanensis на основании этого критерия были бы отнесены к одному виду (Walker, 1988, 1989). Это обстоятельство привело к попытке пересмотреть таксономические правила, применяемые к риккетсиям, чтобы разъяснить статус всех в настоящее время известных риккетсий и разработать руководящие принципы для классификации и наименования риккетсиальных изолятов. В частности, было предложено секвенировать последовательности риккетсиальных изолятов генов уже изученных риккетсий (Raoult D., et al., 2005).

Для прохождения процедуры описания нового вида риккетсий необходимо изолировать оригинальный микроорганизм, изучить его фенотипические признаки и генотипические характеристики, и в завершение описание нового вида должно быть опубликовано предпочтительно в Int. J. Syst. Evol. Microbiol. или в Int. J Syst. Bacteriol. (схема 2). Необходимым требованием является депонирование изолированных штаммов в двух коллекциях, официально признанных World Data Centre for Microorganisms. Эти правила :должны исключить прецедент официального описания некультивируемых видов, как например R. peacockii. Такие риккетсии должны быть классифицированы как Candidatus «Rickettsia sp.».