Таксономия Rickettsials

Риккетсии
Семейство Rickettsiaceae
Таксономия Rickettsials
Краткая характеристика рода Rickettsia
Антигенное строение риккетсий
Культуральные и физиологические особенности
Микроэкология возбудителей, круг хозяев и среда естественного обитания
Генетическая характеристика
Факторы патогенности
Клинические проявления в связи с особенностями инфекционного процесса
Основные нозологические формы и особенности клинического и эпидемиологического проявления риккетсиозов
Иммунитет при риккетсиозах
Эколого-эпидемиологическая характеристика
Микробиологическая диагностика риккетсиозов
Определение чувствительности к антибактериальным препаратам
Лечение и профилактика
Апатогенные риккетсии и концепция эндоцитобиоза прокариотов
Географическое распространение риккетсий группы КПЛ
Экспериментальные методы изучения риккетсии в переносчиках

Внедрение комплекса молекулярно-биологических и филогенетических методов позволило существенно пересмотреть представление о таксономии риккетсий. Применение ПЦР и секвенирования, в особенности при изучении гена, кодирующего 16S рРНК (Weisburg et al., 1989), обосновало изменения таксономической классификации бактерий, особенно внутриклеточных бактерий, классификация которых была построена на ограниченном количестве фенотипических критериев. Применение новых молекулярных технологий (секвенирование) произвело революцию в изучении генов и генома и позволило представить филогенетическую позицию изучаемых объектов. Результаты, полученные при изучении гена, кодирующего 16S рРНК представителей порядка Rickettsiales, позволили внести некоторые изменения в классификацию, представленную в Bergey's Manual.

Порядок Rickettsiales сохранил свое место в альфа-подклассе Proteobacteria, однако реклассификация коснулась некоторых родов, его представляющих, не говоря об изменениях, коснувшихся таксономии отдельных видов бактерий. Первоначально три представителя этого порядка (Rickettsiella grilli, Coxiella burnetii и Wolbachia persica) были перемещены в гамма-подгруппу Proteobacteria (Weisburg et al., 1989; Roux et al., 1997). Далее рода Rochalimaea и Grahamella были перемещены в род Bartonella, который был убран из порядка Rickettsiales (Brenner et al., 1993; Birtles et al., 1995). В настоящее время этот порядок представлен следующими родами: Rickettsia, Orientia, Ehrlichia, Anaplasma, NeoRickettsia и Wolbachia.

Изначально род Rickettsia подразделялся на три группы: СТ, КПЛ и группы КТ (с единственным представителем R. tsutsugamushi) (Weiss and Moulder, 1984). Разделение на эти три группы исторически основывалось на фенотипических критериях. Эта классификация претерпела значительные изменения в результате анализа нуклеотидных последовательностей, полученных при секвенировании гена 16S рРНК всех известных риккетсий. Позиция R. tsutsugamushi, единственного представителя группы КТ, являвшейся достаточно удаленной, оправдало дальнейшее перемещение в новый род, Orientia, как О. tsutsugamushi (Tamura et al., 1995). В дополнение к этому Stothard et al. предложили создать новую группу внутри рода Rickettsia, включая R. canadensis, R. bellii и АВ bacterium (Stochard and Fuerst P.A., 1995). В настоящее время род Rickettsia охватывает родственные группы: группу СТ, включающую R. prowazekii и R. typhi, и группу КПЛ, включающую 18 видов риккетсий. Однако настоящая таксономическая классификация является дискуссионной и не окончательной. Ряд исследователей (Fuxelius et al., 2007; Gillespie et al., 2007; 2008) на основании анализа полноразмерных геномов выделяет в роде Rickettsia 4 группы: предковую группу (R. bellii и R. canadensis), группу тифа (R. prowazekii и R. typhi), группу пятнистой лихорадки (R. rickettsii, R. parkeri, R. conorii и др.) и промежуточную, или переходную группу (R. akari, R. australis и R. felis).